I. 背景 | |
HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發(fā)現的,多年來(lái)一直被公認為引起普通感冒的原因,并在一生中引起頻繁的再感染。在成年人中,這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%,在高峰期高達35%。兒童的年發(fā)病率達到8%,最高發(fā)病率高達20%。據報道,成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等,其中有80%的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人。 根據CDC和WHO的介紹,針對HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于對應藥物和疫苗的開(kāi)發(fā)。NCBI收錄序列為KX344031.1,全長(cháng)30713bp,基因編碼5個(gè)結構蛋白:S,M,N,HE和E。 以往針對試劑盒檢測限的性能評價(jià),一般是選擇體外轉錄的RNA、或者臨床陽(yáng)性病毒來(lái)作為標準品,用于性能評價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽(yáng)性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實(shí)驗室級別為P3-P4,大部分開(kāi)發(fā)診斷試劑盒單位都不滿(mǎn)足改要求,另外臨床陽(yáng)性病毒也是來(lái)源很有限,不能被穩定供應,反復用于試劑盒的性能評價(jià)。 |
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II.產(chǎn)品描述 | |
有病毒的完整包膜結構,有HCoV-OC43對應的核酸序列,但是生物安全風(fēng)險較低的假病毒標準品,完美的克服了選擇體外轉錄的RNA、或者臨床陽(yáng)性病毒來(lái)作為標準品的缺點(diǎn),非常適合用于核酸診斷性能評價(jià)的標準品。 構建過(guò)程:HCoV-OC43基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測(ddPCR) |
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III. 產(chǎn)品介紹 | |
產(chǎn)品名稱(chēng): | hCov-OC43-E Pseudovirus Standard Reference |
對應序列(詳情見(jiàn)附錄): |
Gene E(255bp) |
產(chǎn)品規格: | 1ml |
拷貝數: | >1x10e7copies/ml |
生物安全級別: | P2 |
運輸與保存方式: | 干冰運輸,-90 ~ -70°C保存 |
有效期: | |
IV. 產(chǎn)品用途與優(yōu)勢 | |
產(chǎn)品用途: | HCoV-OC43診斷試劑盒性能評價(jià) |
產(chǎn)品優(yōu)勢: | • HCoV-OC43的假病毒標準品,區別于以往體外合成的RNA、臨床陽(yáng)性活病毒,完美克服兩者的缺點(diǎn),真正適合用于試劑盒的性能評價(jià),包含檢測限、特異性,重復性等;
• 根據HCoV-OC43冠狀病毒的特點(diǎn),選取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計3個(gè)區段的序列,用于假病毒的包裝,3個(gè)區段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列; • 科佰生物設計了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構建標準曲線(xiàn)的前提下完成對假病毒的QC拷貝數檢測,非常準確表征標準品的拷貝數,而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標準的不準確性; • 假病毒標準品,無(wú)致病性,可再生,質(zhì)控方法可靠,批次間穩定,可以長(cháng)期穩定制備和供應,而且要求實(shí)驗室生物安全級別為P2,滿(mǎn)足很多單位的安全需求。 |
Ⅴ. 附錄 | |
Gene E: ATGTTTATGGCTGATGCTTATCTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTGGTTACAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTG TGTATTCAACTTTGCGGTATGTGTAATACCTTAGTACTGTCCCCTTCTATTTATGTGTTTAATAGAGGTAGGCAGTTTTATGAGTTTTACAATGATGTAAAACCACCAGTCCTTGATGTGGAT GACGTTTAG |